В документе «расходная накладная» в процедуре ОбработкаПроведенияБУ в запросе есть условие:

И РасходнаяНакладнаяСписокНоменклатуры.Номенклатура.ВидНоменклатуры <> &ВидНоменклатурыУслуга.

Поэтому услуги не попадают в выборку и по ним не будет движений в РБ.

В вашей тестовой базе я создала расходную накладную, в которой есть услуги, — по ним не формируются проводки.

По товарам будут проводки «покупатели-прибыли/убытки»,  а по услугам — нет.

Видимо, достаточно в запросе перенести ВидНоменклатуры из условия в поле, и потом при обходе выборке если это услуга, то формируем проводку только на «покупатели-прибыли/убытки», а если не услуга — то еще и на списание товаров.